Зміст

• Файл вирівнювання за типом файлу
• Двійковий
• Що таке файл CRAM?
• Про файли CRAM

Файл вирівнювання за типом файлу

Розробник	EBI
Популярність	3,0 (1 голос)
Категорія	Файли даних
Формат	Двійковий X Двійковий Цей файл зберігається у двійковому форматі, для чого потрібно читати його вміст.

Що таке файл CRAM?

Формат файлу стисненого вирівнювання, розроблений EBI, станція Європейської лабораторії молекулярної біології; зберігає короткі послідовності зчитування послідовності ДНК, що генеруються з вирівнювання коротких чисел, таких як BWA, BBMap і BLAT. Більше інформації

Формат файлу CRAM подібний до формату файлу BAM (Binary Alignment / Map), але має краще стиснення файлів і реструктуризований двійковий формат контейнера з колонкою. Оскільки обсяги даних збільшуються в області генетичного програмного забезпечення, формат CRAM був розроблений для зменшення відбитків диска на ногах вирівнювання.

Коротке вирівнювання читання є процесом дешифрування, звідки походить послідовність в геномі. Це може бути важким, оскільки еталонний геном досить великий, і ви не завжди шукаєте точні збіги в референційному геномі. Короткі збірки зчитування використовуються для пошуку величезних послідовностей для матчів і близьких матчів. Оскільки послідовності настільки великі, стиснення, яке надає формат CRAM, необхідне для керування розмірами файлів.

СКАЧАТИ БЕЗКОШТОВНО Отримати File Viewer для Android програми, які відкривають CRAM файли

Windows

Samtools

Оновлено 1/11/2016

Про файли CRAM

Наша мета - допомогти вам зрозуміти, що таке файл з суфіксом * .cram і як його відкрити.

Тип файлу стисненого вирівнювання, опис формату файлу та програми Windows, перелічені на цій сторінці, були індивідуально досліджені та перевірені командою FileInfo. Ми прагнемо до 100-відсоткової точності та публікуємо лише інформацію про формати файлів, які ми перевірили та перевірили.

Якщо ви хочете запропонувати будь-які доповнення або оновлення цієї сторінки, повідомте нам про це.